保护区始建于年7月1日，位于泗洪县东南，洪泽湖西北部，地处南暖温带与北亚热带的过渡地带，包括部分湖面、滩地及溧河洼，湿地类型主要有浅水湖泊湿地、浅滩沼泽湿地、河流湿地等。总面积公顷。

年2月11日被国务院批准晋升为国家级自然保护区。

江苏泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区由原杨毛嘴湿地为中心的天然湿地生态系统、湖滨珍禽鸟类保护区、生态森林公园（休闲度假区）、生物多样化科普区、万亩水产养殖生态示范区和万亩无公害稻蟹立体养殖示范区六大功能区组合而成，以湿地生态系统、大鸨等鸟类、鱼类产卵场及地质剖面为主要保护对象。

截至年，洪泽湖鸟类共有种，隶属14目40科76属，约占全国鸟类总数的16.3%。其中，候鸟有种（夏候鸟41种，冬候鸟59种)，旅鸟有51种，留鸟有43种。

洪泽湖是长江淡水鱼类和水生生物重要的繁衍地，同时也是长江鱼类重要的洄游场所。年，江苏泗洪洪泽湖湿地国家级自然保护区内共发现鱼类67种，分别隶属于7目11科；两栖动物7种，共4科6属，其中金线蛙和黑斑蛙属省级保护动物；爬行动物14种，属2目8科；哺乳动物15种，分属5目6科；另有浮游生物91种，底栖动物76种。

珍惜濒危动物

据调查，平均每年到洪泽湖湿地越冬的水鸟总数在50万只以上，其中国家Ⅰ级保护动物的鸟类有大鸨、东方白鹳、黑鹳、丹顶鹤等，国家Ⅱ级保护鸟类26种：小天鹅、鸳鸯、黑耳鸢、雀鹰、苍鹰、游隼、红隼等。其中列入IUCN红色名录的受威胁鸟类有12种。

地层剖面化石

下草湾标准地层剖面结构完整，含丰富的化石动物群，属古脊椎类动物有70多种，其中三种灵长类化石被命名为：双沟醉猿、江淮宽齿猿和江苏古猿泗洪种。因此，下草湾标准地层剖面，特别是泗洪古猿化石和下草湾新人的发现，对人类起源与区域分布的研究，提供了新的依据，是研究人类区域环境历史演变的重要区域。